Software kimia molekul viewer gratis terbaik untuk Windows

Berikut adalah daftar software molekul viewer gratis terbaik untuk Windows. Software penampil molekul ini bermanfaat bagi penggemar sains untuk memvisualisasikan dan mempelajari struktur molekul dalam 3D. Untuk melihat struktur molekul, Anda perlu mengimpor file molekul. Sebagian besar software visualisasi molekul ini mendukung format file yang berbeda termasuk Protein Databank (PDB), File Model Molekuler (XYZ), Alchemy File Format, Sybyl MOL2 Format, MDL Mol File Format, Format File CIF, Format File MOPAC, dll. Properti molekul juga ditampilkan dalam statistik yang berkaitan dengan atoms, bonds, mass number, atomic number, dll.  Anda bahkan dapat mengedit molekul atau membangun file molekul dari awal.

Untuk memudahkan proses visualisasi molekuler, Software yang saya share ini menyediakan semua alat bantu navigasi dan layar yang penting dan canggih. Anda dapat menyesuaikan struktur molekul yang ditampilkan dengan mengubah gaya rendering molekul seperti Wireframe, Backbone, Stick, Spacefill, Balls & Stick, Pita, Strands, dll. Selanjutnya, Anda dapat menyesuaikan preferensi seperti label acara, skema warna, titik cahaya, kedalaman cueing, lingkaran cahaya, cahaya ambient, perbatasan, dll. Anda dapat dengan mudah menavigasi melalui struktur molekul menggunakan alat seperti zoom in / out, rotate, auto-rotate, move, spin, dll. Anda juga dapat mengekspor struktur molekul khusus sebagai gambar di semua software penampil molekul ini. Plus, beberapa di antaranya memungkinkan Anda untuk membuat animasi molekul juga.

Berikut daftar Software kimia molekul viewer gratis terbaik:

IQmol

IQmol adalah penampil molekul open source gratis serta software editor molekul untuk Windows. Ini menyediakan sejumlah alat untuk memvisualisasikan struktur molekul dan mempelajari sifat-sifat molekul. Untuk melihat molekul, Anda dapat membuka file molekul seperti PDB, MOL, CUBE, dll. Format impor yang didukung tidak jelas karena tidak menyebutkannya. Ketika Anda membuka file molekul, tampilan model masing-masing dapat dilihat dari panel kiri. Ini termasuk atoms, bonds (bond length), geometries, dll. Anda dapat menambahkan dan mengkonfigurasi permukaan juga dengan menentukan jenis (Van Der Waals, Promolecule, SID), Isovalue, color, opacity, quality, dll. Untuk melihat molekul, software ini memungkinkan Anda mengatur properti tampilan seperti show axes, camera configurations (projection, rotation, positions, etc.), appearance (shader, POV-Ray), atom labels (element, index, mass, NMR, partial charge, spin density), dll. Ini memungkinkan Anda melihat dan menganalisis molekul dalam mode layar penuh juga. Anda dapat memutar struktur, memperbesar / memperkecil, memutar, dll. Akhirnya, Anda dapat menyimpan struktur molekul yang ditampilkan sebagai gambar PNG, BMP, dll. Menyediakan juga opsi untuk merekam animasi yang pada dasarnya menyimpan setiap bingkai animasi sebagai Gambar BMP.

Karena ini adalah editor molekul, Anda juga dapat membangun atau mengedit molekul. Dari menu Build-nya, Anda dapat menemukan opsi seperti Insert Molecules by ID, Fill Valencies With Hydrogens, Set Isotopes, Set Geometric Constraints, Minimize Structure, Select Force Field, Symmeterize Molecule, Set Symmetry Tolerance dll. Setelah membangun atau mengedit molekul, Anda dapat menyimpannya dalam file. Format file untuk menyimpan molekul termasuk XYZ, PDB, CML, MOL, GZMAT, dll. Ini juga memberikan pilihan untuk perhitungan Q-Chem. Secara keseluruhan, ini adalah software visualisasi molekul besar yang memiliki antarmuka pengguna yang bersih dan intuitif.

Unduh IQmol dari situs resminya.

Molekel

Molekel adalah penampil molekul 3D yang bagus dengan GUI yang bersih. Di dalamnya, Anda dapat membuka file-file molekul dan kemudian memvisualisasikan dan mempelajari molekul dengan menyesuaikan beberapa opsi tampilan. Untuk memasukkan file molekul, ia mendukung berbagai format yang mencakup PDB, XYZ, YOB, ALC, SDF, SMI, RXN, PCM, PQS, MOL, MOL2, TMOL, dan lainnya. Segera setelah Anda mengimpor file molekuler, Anda dapat melihat representasi visual dan propertinya pada antarmuka utama. Properti termasuk statistik yang berkaitan dengan atoms, bonds, energy, residues, conformers, molar mass, exact mass, spin multiplicity, charge, vibration frequencies, dll. Berikut adalah fitur yang disediakan oleh freeware ini:

• Pengaturan tampilan molekul seperti bentuk molekul (CPK, stick, ball & stick, wireframe, dll.), Bentuk atom (belahan, bola, billboard, dll.), Bentuk ikatan, residu, detail atom, warna atom, skala, dll., dapat dikonfigurasi.
• Selain itu, pada opsi tampilan Anda dapat menyesuaikan latar belakang dan properti tampilan 3D dan mengaktifkan / menonaktifkan probe pesawat, skal skal MEP, kotak pembatas, sumbu, dll.
• Anda dapat memutar, atau memperbesar / memperkecil struktur molekul menggunakan mouse Anda.
• Menyediakan mode interaksi yang berbeda untuk meningkatkan pengalaman menonton termasuk Kamera, Molecule, dan Pick Atom / Bond.
• Memungkinkan Anda memvisualisasikan permukaan yang dihasilkan dengan kerapatan elektron, garis grid, permukaan yang dapat dijangkau pelarut, dan permukaan yang dikeluarkan pelarut. Permukaan yang dapat dilepas pelarut dan permukaan yang dikeluarkan pelarut pertama kali dihitung saat Anda menentukan parameter terkait.
• Memungkinkan Anda membuka file molekul yang berbeda dan memvisualisasikan semuanya sekaligus. Jadi, dengan cara ini, Anda dapat menggabungkan dan menyimpan file molekul dalam format yang didukung.
• Anda dapat menyimpan tampilan molekuler sebagai gambar (PNG, TIFF), PostScript, EPS, atau file PDF.

Beberapa alat analisis tambahan tersedia di dalamnya yang meliputi Probe Plane, Spektrum Radiasi, dll.

Unduh Molekel dari situs resminya.

Avogadro

Avogadro adalah penampil molekul lintas platform yang gratis, terbuka, dan terbuka dalam daftar ini. Ini adalah pencipta molekul dan perangkat lunak editor juga. Untuk memvisualisasikan molekul, Anda dapat mengimpor file dalam format seperti PDB, CML, CIF, FCHK, GAMOUT, MOL, MOL2, SDF, DMOL, dll. Molekul dapat divisualisasikan dalam proyeksi Perspektif atau Orthogonal. Pilihan tampilan dasar seperti rotate, zoom in / out, seleksi, dll., Tersedia di dalamnya. Selain itu, Anda mendapatkan alat rotasi otomatis, alat pengoptimalan otomatis, mode layar penuh, dan opsi menyelaraskan molekul. Ini menyediakan fitur seleksi lanjutan yang memungkinkan Anda memilih dengan elemen, residu, pola SMARTS, pelarut, dll. Anda dapat melihat properti molekul, atom, ikatan, sudut, torsi, dan konformer juga. Representasi molekul dapat diekspor sebagai gambar PNG, BMP, atau JPEG. Anda juga dapat mengekspor grafik vektor (PDF, SVG, EPS), POV-Ray, dan model VRML.

Lihat juga: Software bioinformatika gratis terbaik untuk Windows

Anda dapat membangun molekul di dalamnya menggunakan alat seperti Add Hydrogens, Insert Fragment, DNA/RNA, SMILES, and Peptide, Super Cell Builder, Nanotube Builder, Change H to Methyl, Cartesian Editor, dll. Banyak alat canggih seperti Animate Trajectory, Optimize Geometry, Calculate Energy, Setup Force Field, Crystallography, dll., Juga tersedia. Sofware ini berisi berbagai plugin yang membantu Anda menganalisis struktur molekul seperti berinteraksi dengan molekul, membuat dialog file input untuk kode kuantum, menghasilkan dialog properti molekul, membuat permukaan, dll.

Unduh Avogadro dari situs resminya.

Itulah ketiga software kimia molekul viewer gratis terbaik, semoga bermanfaat dan terima kasih atas kunjungannya.